| I. 水生與濕地植物 | ||
| 科別( APG IV ) | 中 文 名 稱 | |
| 三白草科(Saururaceae) | 三白草、蕺菜(魚腥草) | |
| 千屈菜科(Lythraceae) | 圓葉節節菜(水猪母乳)、克非亞草 | |
| 天南星科(Araceae) | ||
| 禾本科(Gramineae) | 巴拉草、薏苡、李氏禾 | |
| 石竹科(Caryophyllaceae) | ||
| 玉蕊科(Lecythidaceae) | 穗花棋盤腳(水茄冬) | |
| 玄參科(Scrophulariaceae) | ||
| 田蔥科(Philydraceae) | ||
| 車前科(Plantaginaceae) | 過長沙、田香草(大葉石龍尾) | |
| 金絲桃科(Hypericaceae) | ||
| 柳葉菜科(Onagraceae) | 水丁香、台灣水龍 | |
| 唇形科(Labiatae) | 地筍、墾丁水薄荷 | |
| 桔梗科(Campanulaceae) | ||
| 茜草科(Rubiaceae) | 風箱樹 | |
| 密穗桔梗科(Sphenocleaceae) | 尖瓣花 | |
| 莎草科(Cyperaceae) | 茳茳鹹草、荸薺、三儉草、螢藺(大井氏水莞)、水毛花 | |
| 菖蒲科(Acoraceae) | 菖蒲、石菖蒲 | |
| 菫菜科(Violaceae) | 匍菫菜(如意草)、短毛菫菜 | |
| 楊柳科(Salicaceae) | 水社柳、水柳 | |
| 睡蓮科(Nymphaeaceae) | 睡蓮(子午蓮)、台灣萍蓬草 | |
| 蓮科(Nelumbonaceae) | 荷花(蓮花) | |
| 蓼科(Polygonaceae) | 細葉雀翹 | |
| 穀精草科(Eriocaulaceae) | 連蕚穀精草、大葉穀精草 | |
| 澤瀉科(Alismataceae) | 澤瀉(窄葉澤瀉)、慈姑(三腳剪) | |
| 燈心草科(Juncaceae) | 燈心草 | |
| 爵床科(Acanthaceae) | 爵床、柳葉水蓑衣 | |
| 薑科(Zingiberaceae) | 穗花山奈(野薑花) | |
| 繖形科(Umbelliferae) | 水芹菜、台灣澤芹(細葉零餘子) | |
II. 陸生植物 | ||
| 大麻科(Cannabaceae) | 葎草 | |
| 大戟科(Euphorbiaceae) | 鍚蘭饅頭果、烏臼 | |
| 山柑科(Capparidaceae) | 魚木 | |
| 千屈菜科(Lythraceae) | 九芎 | |
| 木犀科(Oleaceae) | 光臘樹(白鷄油) | |
| 木蘭科(Magnoliaceae) | 烏心石 | |
| 天南星科(Araceae) | ||
| 五加科(Araliaceae) | 通脫木(通草) | |
| 毛茛科(Ranunculaceae) | 串鼻龍 | |
| 母草科(Linderniaceae) | ||
| 冬青科(Aquifoliaceae) | ||
| 灰木科(Symplocaceae) | 灰木 | |
| 百合科(Liliaceae) | 台灣油點草、文珠蘭 | |
| 杜鵑花科(Ericaceae) | 烏來杜鵑、 | |
| 夾竹桃科(Apocynaceae) | 馬利筋 (金鳳花) | |
| 豆科蝶形花亞科(Papilionaceae) | 蠅翼草 | |
| 防己科(Menispermaceae) | ||
| 五福花科(Adoxaceae) | 呂宋莢蒾 | |
| 芸香科(Rutaceae) | 山刈葉、食茱萸 | |
| 芭蕉科(Musaceae) | 台灣芭蕉 | |
| 八仙花科(Hydrangeaceae) | ||
| 胡頹子科(Elaeagnaceae) | ||
| 桑科(Moraceae) | 菲律賓榕、小葉桑、雀榕 | |
| 茶科(Theaceae) | 凹葉柃木 | |
| 茜草科(Rubiaceae) | 山黃槴、鷄屎藤 | |
| 唇形科(Labiatae) | 杜虹花(台灣紫珠) | |
| 野牡丹科(Melastomataceae) | 野牡丹 | |
| 殼斗科(Fagaceae) | 青剛櫟 | |
| 無患子科(Sapindaceae) | 無患子 | |
| 菊科(Asteraceae) | 蟛蜞菊 | |
| 紫金牛科(Myrsinaceae) | 台灣山桂花 | |
| 楝科(Meliaceae) | 楝(苦楝) | |
| 葡萄科(Vitaceae) | 漢氏山葡萄 | |
| 瑞香科(Thymelaeaceae) | 南嶺蕘花 | |
| 遠志科(Polygalaceae) | 圓錐遠志(齒果草) | |
| 樟科(Lauraceae) | 豬腳楠(紅楠) | |
| 蕁麻科(Urticaceae) | 密花苧麻、水麻 | |
| 錦葵科(Malvaceae) | 山芙蓉、野棉花、梵天花 | |
| 薑科(Zingiberaceae) | 月桃 | |
| 漆樹科 (Anacardiaceae) | 羅氏鹽膚木 | |
III. 蕨類植物 | ||
| 蹄蓋蕨科(Athyriaceae) | 過溝菜蕨、假蹄蓋蕨、細柄雙蓋蕨、臺灣雙蓋蕨、廣葉鋸齒雙蓋蕨 | |
| 碗蕨科(Dennstaedtiaceae) | 華南鱗蓋蕨、克氏鱗蓋蕨、臺北鱗蓋蕨、粗毛鱗蓋蕨、栗蕨、姬蕨 | |
| 腎蕨科(Nephrolepidaceae) | 腎蕨、毛葉腎蕨 | |
| 卷柏科(Selaginellaceae) | 生根卷柏 | |
| 海金沙科(Lygodiaceae) | ||
| 合囊蕨科(Marattiaceae) | 觀音座蓮 | |
| 烏毛蕨科(Blechnaceae) | ||
| 桫欏科(Cyatheaceae) | 筆筒樹、鬼桫欏、臺灣桫欏、臺灣樹蕨 | |
| 鳳尾蕨科(水蕨亞科) | 水蕨 | |
| 鳳尾蕨科(竹葉蕨亞科) | 粉葉蕨 | |
| 槐葉蘋科(Salviniaceae) | 人厭槐葉蘋 (速生槐葉蘋)、滿江紅 | |
| 瓶爾小草科(Ophioglossaceae) | 銳頭瓶爾小草 | |
| 田字草科(Marileaceae) | 田字草 | |
| 木賊科(Equisetaceae) | 分枝木賊 | |